一旦发生肥害应立即喷水，可以用通风去湿。施用充分腐熟的有机肥。无论是营养士堆制时使用的有机肥，或是苗期追肥中使用的有机肥，均须经过充分发酵腐烂。追施有机肥必须在晴天的中午前后进行，并用清水喷淋，然后通风降湿，严禁秧苗叶片、茎秆上沾有粪肥。二，大田肥害秧苗移栽到大田后，如果所采用的粪肥腐熟不彻底或未经腐熟，它们在土壤中发生腐烂分解，会产生热量而烧坏秧苗的根系。第二种情况是，秧苗移栽成活后，我们需要追肥，如果用肥量过大，或者是追肥太靠近根系，化肥溶解造成根系周围土壤溶液浓度过高，必然会导致根系的萎缩，甚至腐烂，发生烧根现象。
第三种情况就是，叶面喷肥造成的肥害，同苗床根外追肥的症状一样，也是由于喷施的浓度过高，或者喷施的时间不恰当导致的。因此，我们在给秧苗追肥时，一定要注意追肥的量和追施的距离，要少施勤施，多次少量，化肥的追施应与秧苗保持一定的距离，至少在5厘米以上，不可太靠近根茎基部，以防烧苗。如果发现秧苗出现肥害，马上浇清水稀释土壤中化肥的浓度，同时叶面布喷清水，或者是喷施芸苔素内酯，天达2116，赤霉素等，促进根系的发生，减轻肥害。秧苗因太弱小，在日常管理中，如果操作不当，不但会发生肥害，有时候还会发生药害，在这里一并说一下。
三，药害蔬菜秧苗柔嫩，耐药性能差，农药使用不当，易产生药害。发生药害时，秧苗叶片扭曲畸形或叶缘黄化逐渐干枯，生长受阻，甚至死亡。发生药害的主要原因是农药选择不当，浓度过高，配制不均，喷药时间不当，施用时用量过多。防止药害的方法是要根据不同的病虫害进行对症下药，浓度要适当，配制时充分搅拌均匀，喷施雾点细而匀，不能集中局部地点喷雾过长时间，以叶上有水滴下即可。如发现喷施浓度过大，应立即喷清水，避免发生药害。喷药时间宜在上午通风1~2小时后进行，严禁晴天闷棚时喷药。