瓜子黄杨为喜荫树种，种植地以通气透光处为佳。在夏季高温高湿条件下，最好能选择早晚和阴雨天种植，适当增大黄杨树苗之间的间距。如果植株间隔太小就会长期荫蔽并且通风不畅，易使植株枝叶软弱。黄杨耐寒性较强，可耐零下20度左右严寒，但对晚秋或早春萌发新枝的植株则应注意保温，最好置于室内，以防低温对植株幼苗产生冻害。
瓜子黄杨的种植四季均可进行，以植株休眠期或梅雨期最佳。种植的土壤以腐殖土、稻田土或山泥等为主，土壤以微酸、中性或微碱为宜。如对您当地的土壤不太满意，可以植株所带土壤配以三分之一兰花土或蛭石、泥炭等拌和使用。同时可先在土中适当加上少量豆饼或豆屑等，任其在土中发酵挥发成为迟效型养料，使植株缓慢受益。地栽的植株根系如果十分发达，种植时可适当剪去植株幼苗部分主根，须根太多也可抽去一些，不要将须根团缩在土内。