一旦种植大面积的冬枣苗，就需要加强对他们的管理。首先要及时的施肥，根据冬枣苗的需要进行把握，合理施肥。一般情况下，有机肥、中微肥或者是复合肥都是可以使用的，这些肥料缺一不可。化学肥料可以跟符合肥料一起混合使用，这样可以更有效的促进果苗的生长。
后期的管理过程中还需要进行疏果，科学疏果是为了提高冬枣的质量，在冬枣苗成长之后就会开花结果，对于果实的管理也是非常重要的一个步骤。一般疏果的要求就是留优去劣，从上往下、从内到外，先后除去小果和病果，一般疏果是进行2次就可以，7月上旬和7月中旬各一次就可以。
关于冬枣苗病虫的防治也很重要，一般就是加强对斑点病的防治，可通过喷施植物细胞来提高植物的可逆性，强大他们的免疫系统，抑制树苗的病毒，促进植物的加速成长。对于一些食心虫、棉铃虫这样的虫害，可用安打或保德进行防治。