植物在分类学上的分类逐级是：门—亚门—纲—目—科—亚科—系—族—亚族—属—种。
当然有的中间级别也可能没有，有的可能从门直接到科。
低等植物分类：藻类植物门、细菌门、粘菌门、真菌门、地衣门，共五门。
高等植物分类：蕨类植物门、苔藓植物门、种子植物门
（一）裸子植物亚门
（二）被子植物亚门
1、单子叶植物纲2、双子叶植物纲植物的分类
一、以植物茎的形态来分类
1、乔木：有一个直立主干、且高达5米以上的木本植物称为乔木。与低矮的灌木相对应，通常见到的高大树木都是乔木，如木棉、松树、玉兰、白桦等。乔木按冬季或旱季落叶与否又分为落叶乔木和常绿乔木。
2、灌木：主干不明显，常在基部发出多个枝干的木本植物称为灌木，如玫瑰、龙船花、映山红、牡丹等。
3、亚灌木：为矮小的灌木，多年生，茎的上部草质，在开花后枯萎，而基部的茎是木质的,如长春花、决明等。
4、草本植物：草本植物茎含木质细胞少，全株或地上部分容易萎蔫或枯死，如菊花、百合、凤仙等。又分为一年生、二年生和多年生草本。
5、藤本植物：茎长而不能直立，靠倚附它物而向上攀升的植物称为藤本植物。藤本植物依茎的性质又分为木质藤本和草质藤本两大类，常见的紫藤为木质藤本。
藤本植物依据有无特别的攀援器官又分为攀缘性藤本，如瓜类、豌豆、薜荔等具有卷须或不定气根，能卷缠他物生长；缠绕性藤本，如牵牛花、忍冬等，其茎能缠绕他物生长。
二、以植物的生态习性来分类
1、陆生植物：生于陆地上的植物。
2、水生植物：指植物体全部或部分沉于水的植物，如荷花、睡莲等。
3、附生植物：植物体附生于它物上，但能自营生活，不需吸取支持者的养料为生的植物，如大部分热带兰。
4、寄生植物：寄生于其他植物上，并以吸根侵入寄主的组织内吸取养料为自己生活营养的一部分或全部的植物，如桑寄生、菟丝子等。
5、腐生植物：生于腐有机质上，没有叶绿体的植物，如菌类植物、水晶兰等。
三、以植物的生活周期来分类
1、一年生植物：植物的生命周期短，由数星期至数月，在一年内完成其生命过程，然后全株死亡，如白菜、豆角等。
2、二年生植物：植物于第一年种子萌发、生长，至第二年开花结实后枯死的植物，如甜菜。
3、多年生植物：生活周期年复一年，多年生长，如常见的乔木、灌木都是多年生植物。另外还有些多年生草本植物，能生活多年，或地上部分在冬天枯萎，来年继续生长和开花结实。
（一）、哈钦松系统
英国学者哈钦松（J.Hutchinson）于1926年和1934年先后出版《有花植物科志》的第一册和第二册，并在1959、1973年修订第二版和第三版。在书中发表了他的被子植物系统，主要特点是以真花学说为基础，认为两性花、木本、花各部分分离、不定数的为原始，而单性花、花部结合、有定数、草本为次生，花部螺旋排列比轮状排列原始。把双子叶植物分为木本和草本两大支，从木兰目演化出一支木本植物，从毛茛目演化出一支草本植物，认为这两支是平行发展的，单子叶植物起源于双子叶植物的毛茛目。这个系统在我国也有一定影响，如北京大学生物系、中科院华南植物研究所、广西植物研究所、昆明植物研究所的标本馆，科的排列均采用此系统，广州植物志、海南植物志、云南植物志也采用这个系统。科的数目由原来332科增加到411科，其中双子叶植物82目，342科，单子叶植物29目，69科。
哈钦松系统认为多心皮的木兰目、毛茛目是被子植物的原始类群，但过分强调了木本和草本两个来源，认为木本植物均由木兰目演化而来，草本植物均由毛茛目演化而来，结果使得亲缘关系很近的一些科在系统位置上都相隔很远，如草本的伞形科和木本的山茱萸科、五加科；草本的唇形科和木本的马鞭草科等，这种观点亦受到现代多数分类学家所反对。
（二）、恩格勒系统
这是德国分类学家恩格勒(A．Engler)和勃兰特(K．PrantI)于1897年在其《植物自然分科志》巨著中所使用的系统，它是分类学史上第一个比较完整的系统，它将植物界分13门，第13门为种子植物门，再分为裸子植物和被子植物两个亚门，被子植物亚门包括单子叶植物和双子叶植物两个纲，并将双子叶植物纲分为离瓣花亚纲(古生花被亚纲)和合瓣花亚纲(后生花被亚纲)。
恩格勒系统将单子叶植物放在双子叶植物之前，将合瓣花植物归并一类，认为是进化的一群植物，将柔荑花序植物作为双子叶植物中最原始的类群，而把木兰目、毛茛目等认为是较为进化的类群，这些观点为现代许多分类学家所不赞同。思格勒系统几经修订，在1964年出版的《植物分科志要》第十二版中，已把双子叶植物放在单子叶植物之前。共有62目，344科，其中双子叶植物48目，290科，单子叶植物14目，54科。药用植物学教材被子植物分类部分采用修订的思格勒系统，但有的内容有变动。
（三）、美克朗奎斯特系统
国学者克郎奎斯特（A.Cronquist）1958年发表其系统，其后于1968、1981年进行了修订。大纲如下：被子植物门包括11亚纲，83目，383科，16.5万种植物。木兰纲（即双子叶植物）：包含6亚纲，64目，318科。即木兰亚纲、石竹亚纲、金缕梅亚纲、蔷薇亚纲、五桠果亚纲、菊亚纲。百合纲（即单子叶植物纲）：包括5亚纲，19目，65科约6万种植物。即泽泻亚纲、槟榔亚纲、鸭跖草亚纲、姜亚纲、百合亚纲。这个系统近年在我国有较大影响，各级分类系统的安排上较为合理，科的数目及范围较适中，有利于教学使用。近年来高校一些植物学教科书中，被子植物的讲授多数采用该系统。克朗奎斯特系接近于塔赫他间系统，把被子植物门(称木兰植物门)分成木兰纲和百合纲，但取消了“超目”一级分类单元，科的划分也少于塔赫他间系统。
这个系统近年在我国有较大影响，各级分类系统的安排上较为合理，科的数目及范围较适中，有利于教学使用。近年来高校一些植物学教科书中，被子植物的讲授多数采用该系统。
（四）、APG
《被子植物APG分类法》是1998年由被子植物种系发生学组（APG）出版的一种对于被子植物的现代分类法。这种分类法和传统的依照形态分类不同，是主要依照植物的三个基因组DNA的顺序，以亲缘分支的方法分类，包括两个叶绿体和一个核糖体的基因编码。虽然主要依据分子生物学的数据，但是也参照其他方面的理论，例如将真双子叶植物分支和其他原来分到双子叶植物纲中的种类区分，也是根据花粉形态学的理论。
在科一级的分类时，这种分类法因为将一些传统的科分为几个科，或将几个传统的科合并，引起了很大的争议。在目以上的分类时，这种分类法没有使用传统的分类名称：门和纲，而是使用“分支”，例如单子叶植物分支、真双子叶植物分支、蔷薇分支、菊分支等。
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